OS起動時に、設定したアプリを自動起動する「ログイン項目」。
システム環境設定＞ユーザとグループ＞ログイン項目
ここに登録設定していたアプリがOS起動時に起動されず、上の画像のリストに保存されずに消えていた。
いくつか、対応方法はあるようです。
ログイン項目がすべて消える | Apple サポートコミュニティ
とりあえずトラブルシューティング | Apple サポートコミュニティ
他にもいくつか対処法を書いているページはありましたが、大体この2つの方法です。
OSがらみの設定ファイルを手動で削除するのはなんとなくいやなので、２つ目の方法でやってみました。